下列药物可以治疗细菌性阴道病，甲硝唑栓、复方甲硝唑栓、替硝唑栓。口服的甲硝唑片、替硝唑片、克林霉素胶囊在临床上都可以治疗细菌性阴道病。因为细菌性阴道病，主要是由于念珠菌感染所引起的，而甲硝唑或者替硝唑在临床上主要治疗念珠菌感染，所以选择这两种药物治疗。
另外在治疗期间，不可以有性生活，并且建议在阴道塞药之前，最好先用1/5000的高锰酸钾，将阴道内的分泌物冲洗干净，然后再塞药。另外穿过的内裤，一定要太阳下暴晒。