卵巢巧克力囊肿主要是由于子宫内膜异位症的病灶异位在卵巢上，异位的病灶会随着月经每个月都发生周期性出血，这种情况会导致周围组织的粘连，比如可以使输尿管狭窄，输尿管周围组织粘连而造成尿潴留，甚至导致肾功能衰竭的可能性。另外，卵巢巧克力囊肿在临床上可以有40%-50%的病人，会导致不孕不育。巧克力囊肿的病人由于周期性出现出血现象，所以，会导致病人持续性加重的痛经，在临床上使病人苦不堪言。对于巧克力囊肿，建议及时手术治疗。