面肌痉挛手术后的后遗症包括同侧的听力障碍、耳鸣、听力下降，严重的有耳聋，还有迟发性的面瘫、脑脊液耳漏、头晕、走路不稳、复视，以及后组颅神经症状，如吞咽困难、呛咳等。出现了并发症以后，通过一般的治疗，如迟发性面瘫，90%能恢复，听力下降，大部分病人能恢复，有的造成永久性的听力下降和耳聋，至于脑脊液耳漏可以通过手术来修补。眩晕、复视一般都能恢复。随着技术发展，随着显微镜技术的提高，手术的并发症越来越少，但是避免不了。