甲钴胺并不是维生素B12，甲钴胺属于甲基化的维生素B12，属于维生素B12家族中的一种。甲钴胺和维生素B12是不同的药物，甲钴胺主要是内源性的维生素B12，存在于人体的血液、骨髓中，甲钴胺在吸收的情况下，营养神经方面比维生素B12的效果会更好一些，尤其是在治疗周围神经系统病变的时候，效果比维生素B12好。
维生素B12通过口服以后，不能够直接被人体利用，需要进入血循环，通过甲基化然后才能被机体利用，而甲钴胺不通过肝脏代谢，所以可以直接发挥药理作用。