磁共振检查是可以同时检查两个部位的。但是这有前提，需要同时检查的两个部位一定是相邻的或者是在同一个检查区域内的，例如头部和颈部、双侧的下肢、双手以及双肘等。
再有就是前臂和手几乎可以和身体任何部位同时检查。而两个相距较远的部位是不能同时检查的。需要注意的是，无论是哪两个部位同时进行检查，根据物价局规定，都是需要按照两个部位来进行收费。