舌咽神经痛早期发作都是在舌咽神经分布区域导致的疼痛，在一侧的舌根、咽喉、扁桃体、耳根部以及下颌后部皮肤，发作的情况通常是骤然发作、骤然停止，每次发作时间多为数秒至数十秒，一般不超过两分钟。疼痛的性质呈刀割样、针刺样、撕裂、烧灼、电击样剧烈的疼痛。通常于吞咽、说话、咳嗽甚至打哈欠的时候都会诱发疼痛，扳机点往往存在于咽喉壁、扁桃体及舌根处，少数病人可在外耳道区域出现扳机点。