到目前为止，根治性手术切除依然是治疗胆管癌最有效的方法，也是病人获得长期生存和治愈可能的唯一机会。手术方式主要取决于胆管癌发生的部位和胆管癌的TNM分期。肝内胆管癌与原发性肝细胞癌类似，根治性手术方式包括各种解剖性的肝切除术。由于肝内胆管癌淋巴结转移现象较为常见，因此，对怀疑有淋巴结转移的病人应该根据术中淋巴结冰冻结果决定是否进行淋巴结清扫。肝门部胆管癌的手术切除，由于肝门部局部解剖复杂，肿瘤被发现的时候多已侵犯了肝门部的重要部位，所以手术切除率低，能够获得根治性手术切除的病人更少。但即便如此，进行姑息性手术切除对于改善病人的生活质量的作用远远好于经脾肝穿刺胆道引流，或者胆管内支架植入术引流。近年来，随着影像学和手术技术的进步，人们对于肝门部胆管癌的治疗态度也趋于积极，手术范围也逐渐扩大。肝门部胆管癌的手术切除要根据肿瘤的部位、大小、周围脏器受侵犯的情况而决定，临床上多是根据（1：40）Bismuth分型来决定肝切除和淋巴结清扫的范围。对于中段胆管癌可采取肿瘤局部切除、肝十二指肠韧带淋巴结清扫、肝总管空肠吻合术等。对于远端胆管癌一般要进行胰十二指肠切除术。对于不能切除的胆道恶性梗阻疾病的患者，行胆道引流术是缓解症状、提高生活质量、延长病人生命的重要方法。