肛门疼痛大多发生在排便时，便时肛门可出现撕裂样疼痛，便后疼痛可迅速消失，但不久又感到肛门区有烧灼样疼痛伴有便血。
疼痛的时间因人而异，有的再次疼痛只持续半小时左右，有人可持续四小时以上疼痛方消失。这是肛裂的典型症状，造成这种疼痛，是由于粪便过于干硬，通过肛门时撕裂肛管所致，排便时突感肛门剧痛，肛缘有坚硬突起包块，触痛，又不能推入肛门内，血栓性外痔的可能性比较大。
如果排便时有包块从肛门内突出，早期疼痛轻微，脱出物如不及时还纳，会水肿增加，附近皮肤也会凸起，多为嵌顿性内痔。