功能性胃肠病的发生，与心理、社会、生理因素存在密切关系。所以正确的治疗方法是预防发作为主、药物治疗为辅、调节心理状态、改善生活方式、纠正诱发因素。
一、要保持良好的心理状态，保持乐观的情绪，心胸宽广，情绪乐观，心情好胃肠功能就会好。
二、养成健康的生活方式，生活规律，饮食规律，劳逸结合，积极参加文体活动，分散注意力。
三、注意饮食调理。饮食要清淡，多吃新鲜的蔬菜和水果，多吃粗粮，多喝水，多喝酸奶。
四、药物对症治疗，可使用调节胃肠运动或减少胃肠道刺激因素的药物。