败酱草的作用主要是清热解毒，经常以败酱草行散，苦寒降泄。用于胃肠道的湿热火毒，比如常见的脓肿、痈疮以及腹部疼痛，都可以应用败酱草进行治疗。
临床上也可以用来治疗一些肺脓肿，在咳吐之中有大量的脓血、脓痰以及出现了痢疾，特别痢疾带血，也是败酱草的治疗方向。
败酱草治疗肝胆湿热也有一定效果，对于黄疸、尿发红、眼睛发红、周身肿痛也可以用败酱草。对于妇科，可以治疗痛经，还有产后出现瘀阻腹痛，都是败酱草的适应症。