咽喉囊肿包括咽腔的囊肿和喉腔的囊肿，而咽腔的囊肿又分为鼻咽腔的囊肿、口咽腔的囊肿，还有下咽腔的囊肿。
在咽喉部的囊肿根据症状的明显程度，包括囊肿的大小，囊肿比较大会有明显的症状，比如长在鼻咽腔的囊肿可能会堵塞后鼻孔引起鼻塞，或者长在口咽腔的囊肿、会咽等部位的囊肿比较大的时候会有异物感，会影响吞咽。
长在喉腔的囊肿有可能会影响呼吸或者导致声音哑，有这些症状的时候就需要手术切除，药物治疗并没有明显的效果。