过敏性咳嗽和咳嗽变异性哮喘没有十分明显的区别，二者在临床很难鉴别。由于临床有一部分患者以咳嗽为突出临床症状，抗感染治疗效果不佳，肺功能测定显示气道高反应，加用抗过敏的药物、糖皮质激素吸入剂后症状改善，故被命名为咳嗽变异性哮喘，但是其中有相当一部分患者是过敏导致的咳嗽。
咳嗽变异性哮喘与哮喘最大的区别是临床以咳嗽为突出临床症状，几乎没有气喘。虽然治疗的疗程长，但可以治愈，临床上很多患者将咳嗽变异性哮喘误以为是支气管哮喘，殊不知咳嗽变异性哮喘是以过敏、感染、理化因素刺激等单独或共同导致的以咳嗽为突出临床症状的疾病。治疗首当其冲的要抗过敏，还要解痉平喘、止咳化痰，过敏性咳嗽可能在感染的基础上诱发，因此抗感染也是治疗环节中不可忽视的环节。