绝大多数的植物神经功能紊乱是可以治愈的，植物神经功能紊乱是常见病，短期内对身体造成的威胁不太大，如果不及时治疗也会引起多种疾病。轻中度的植物神经紊乱的患者，主要是通过自我调节心理压力，减少工作强度以及身体锻炼，增强抵抗能力，配合药物治疗，很快就能达到治愈，长期拖延的患者出现的重度植物神经紊乱，会引起神经衰弱、抑郁症、高血压。
植物神经紊乱有的患者合并内分泌失调，如果不及时治疗，会引起内分泌失调、卵巢囊肿等妇科疾病，植物神经紊乱的患者应尽早进行调节或治疗，植物神经紊乱早期的患者，可以采用上述调整生活方式的方法进行治疗。
合并有抑郁或者精神症状的患者，可以使用抗精神药物，如安定类药物，控制患者的症状和焦虑症状，对植物神经功能紊乱引起内分泌功能失调的患者，应该到内分泌科诊断。