肝内胆管结石是一个比较严重的疾病，治疗起来比较棘手，对人的影响比较大，因为长期的结石以后会造成肝脏的萎缩、肝脏的纤维化。如果说结石分布比较广，整个肝脏都有结石的话，将来会造成肝脏的肝硬化，肝硬化以后会造成肝脏肝功能失代偿，甚至要面临着做肝移植的风险，所以肝内胆管结石还是比较严重的。
它的后果也是比较严重的，虽然它是一个良性的疾病，但是肝内胆管结石有点类似恶性疾病，它反复的发作，反复的治疗效果不好，并且会危及人的生命，所以必须要也是早发现、早治疗，才有一个好的治疗效果。