柴胡疏肝丸的不良反应主要有以下几点：
1、阴液受损：柴胡疏肝丸的一些药物成分，偏芳香、辛温、燥，对人体的阴液、阴气都会造成影响。
2、对肝肾功能的影响：药物都存在对肝肾的损伤，如果长时间应用，柴胡疏肝丸中的柴胡对肝功能会有明显的影响，甚至导致肝纤维化，临床上一定要注意。
3、脾胃功能受到影响：大量的药物需要脾胃进行运化，会导致脾胃功能下降，甚至出现打嗝、反酸等症状。
4、过敏：柴胡疏肝丸也会诱发过敏等一系列的表现。
柴胡疏肝丸在临床上应用范围很广，药效也很明显，可以疏肝理气、行气止痛。需要在医生的指导下合理应用，对于胆囊炎、慢性胃炎、肝炎的患者，起到一定的治疗效果。