甲癣常由红色毛癣菌、须癣毛癣菌、絮状毛癣菌引起，甲真菌病多由其他的丝状真菌、酵母样菌、酵母菌引起；偶尔也可有头孢子菌、镰刀菌、涂色曲霉等引起，大多见于营养不良的指甲。近年来发现平滑念珠菌也可引起甲真菌病，而且其所占比例逐年增多。