干扰素是可以用于乙肝抗病毒治疗的药物之一。年满18岁的正常成年人，感染乙肝之后，大约80%-90%的机会可以自愈，就是自身的免疫系统可以清除乙肝病毒。
感染早期应用干扰素进行抗病毒治疗的话，可以明显提高乙肝病毒的清除率。长效干扰素每周注射一次或者短效干扰素每两天注射一次，疗程3-4个月。
慢性乙型肝炎阶段，应用干扰素进行抗病毒治疗，同样是长效干扰素每周注射一次或者短效干扰素每两天注射一次，疗程两年。与口服核苷类药物的抗病毒治疗方案相比，应用感染操作麻烦，副作用多。这些副作用包括：应用早期发热，整个应用期乏力、食欲减退、脱发等。但是干扰素疗程固定，两年可以停药。
乙肝肝硬化阶段，因为干扰素可以造成一过性肝功能异常，所以不建议使用干扰素。有特殊需要使用干扰素的，需要减小剂量，延长疗程。