血小板减少的原因有很多，不同原因引起的血小板减少，治疗方法也不同。在血液系统疾病中，最常见引起血小板减少的疾病，是免疫性血小板减少性紫癜，是由于体内产生抗血小板抗体，抗体与血小板结合被脾脏破坏，导致血小板寿命缩短，治疗上首选糖皮质激素。如果患者同时合并重要脏器的出血，急需提升血小板数目，可以应用丙种球蛋白。
其他原因引起的血小板减少，包括严重感染、病毒感染、细菌感染、脓毒症等，应该积极控制感染，感染控制后血小板数目可逐渐恢复正常。另外，某些结缔组织病，例如红斑狼疮、类风湿关节炎等也可以引起血小板减少，应该积极治疗原发病，原发病缓解后，血小板数目可逐渐升高。