十二指肠球炎的治疗，首先要根除致病因素。十二指肠球炎大多是由于幽门螺旋杆菌感染，或者是胃酸分泌过多引起的十二指肠球部的炎症。如果有幽门螺旋杆菌感染，需要及时的进行杀菌治疗，一般采用三联药物或者是四联药物14天疗法。
没有幽门螺旋杆菌感染，可以服用抑制胃酸分泌的药物、保护胃黏膜的药物。同时还是要注意饮食的调理。注意饮食卫生，少食多餐，避免暴饮暴食，戒烟酒，避免辛辣刺激性的食物。避免服用对胃黏膜有刺激性的药物，比如阿司匹林、尼美舒利等。