对于反复发作的扁桃体炎，治疗不仅限于抗生素或手术，应该结合免疫疗法或抗变态反应的措施，包括使用有脱敏作用的细菌制剂以及各种增强免疫力的药物，比如注射胎盘球蛋白、转移因子等。也可以使用局部涂药、隐窝灌洗以及激光疗法，但是可能会远期疗效不理想。平时需要加强体育锻炼，增强体质和抗病能力。对于发作比较频繁，一年4-5次以上或者扁桃体过度肥大，妨碍吞咽、呼吸及发声功能时可以选择手术治疗，也是唯一根治的方法。手术前要避开特殊的生理周期，手术后避免剧烈活动，不要进食过于干硬的食物，完全恢复可能一个月左右。