偏头痛的治疗主要分为非药物治疗和药物治疗，非药物治疗主要是针对危险因素进行预防，避免各种理化因素的刺激。药物治疗包括发作期的急性对症用药以及预防性用药，急性期的对症药物，最常用的是非特异性的镇痛药，比如非甾体类抗炎药，常用的有布洛芬、双氯芬酸、散利痛等等。
还可以加用一些抗组胺类的药物，比如苯海拉明，胃肠动力药和镇静催眠药等等。特异性的镇痛药到目前为止主要使用的是曲普坦类的药物，麦角生物碱类的药物目前因为副作用比较多，相对来说应用比较少。
对于中重度的偏头痛患者，严重影响生活的可以预防性用药，主要包括抗惊厥药物，比如丙戊酸钠、托吡酯以及普萘洛尔、氟桂利嗪等等。