甲状腺切除最大的影响，就是出现术后的甲状腺功能减退症，需要终身服用左甲状腺素钠片进行激素替代治疗。左甲状腺素钠片的剂量取决于患者的病情、年龄、体重以及个体差异，如果以适当的剂量使用时，左甲状腺素钠片几乎没有副作用，服用过量会引起食欲增加、心悸、颤抖、失眠等不良的副作用。
左甲状腺素钠片最好每天空腹服用，在服药后一小时再进食或者是服用其它的药物。另外在甲状腺切除的同时，有时候可能会碰到甲状旁腺导致甲状旁腺功能减退症，有时候会引起喉返神经或者喉上神经的受损，患者会出现呛咳以及声音嘶哑。