转氨酶升高说明存在肝细胞的损伤，临床上有很多药物都可以达到降低转氨酶的效果。轻度的转氨酶升高可以选择口服药物，比如美能、葵花护肝片、易善复等。如果转氨酶升高程度非常显著，这时还可以通过静脉用药达到快速降低转氨酶的效果，常用的药物有复方甘草酸铵注射液、多烯磷脂酰胆碱注射液、注射用还原型谷胱甘肽、硫普罗宁注射液等。可以单独应用，也可以联合应用。
应用药物使转氨酶下降，甚至恢复正常以后并不代表临床病变出现好转，比如乙肝的患者即使转氨酶出现下降，如果乙肝病毒DNA定量仍然维持着较高的水平，这时损害因素是持续存在的。在停用降酶药物以后，转氨酶也会再次出现升高。因此，及时查找引起转氨酶升高的原因，针对病因进行处理才是最重要的，不过辅助用药也可以更好的降低转氨酶，这是应当注意的。