新冠疫苗和其他疫苗一样，在上市前都经过了动物试验、人体预测试试验，及人群Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期临床试验，疫苗安全性得到了多次验证，是非常好的。从动物试验角度，各类疫苗的安全性都非常好。人用疫苗方面，从目前的不良反应公开信息来看，安全性最好的是灭活疫苗，但不代表其他疫苗安全性不好，只是相对不良反应稍多一些。
与其他任何疫苗一样，接种新冠的灭活疫苗可能会出现一些常见的一般反应，如接种部位的酸胀、红肿、疼痛、瘙痒等。极少数人因个体差异，可能会出现发热、乏力、恶心、头痛、肌肉酸痛等，一般不需要处理，2-3天后大多可自行恢复，目前尚未监测到发生与疫苗相关的严重不良反应。
由于疫苗所含成分的特异性属性有可能诱发过敏性反应，这是疫苗本身特性之一，由此产生的不良反应，不代表疫苗本身的质量和安全性存在问题，所以对于曾经有过过敏史的人群，在接种前一定要如实告知医生，由医生判定是否能够正常接种，切不可有所隐瞒，从而导致意外不良反应的发生。