卵巢囊肿腹腔镜手术流程如下：
1、术区消毒：腹部常规消毒，必要时可以进行外阴以及阴道消毒。
2、人工气腹的建立：患者取平卧位，根据穿刺器外鞘直径，切开拟定观察镜穿刺点处皮肤及皮下筋膜，提起腹壁，气腹针与腹部皮肤呈90度，沿切口穿刺进入腹腔，连接自动二氧化碳气腹机。
3、放置腹腔镜：提起患者腹壁，沿皮肤切开置入穿刺器，当穿刺入腹壁筋膜层及腹膜层后有突破感，去除套管内针芯，打开摄像系统及冷光源，将腹腔镜沿套管放入腹腔，可见盆腔脏器后，连接二氧化碳气腹机开始镜下操作。
4、腹腔镜探查：按照顺序常规检查盆腹腔。如果患者有卵巢囊肿，根据具体情况选择卵巢囊肿剔除术或者附件切除术，应根据术中具体的情况进行决定。手术结束后，要用生理盐水冲洗盆腹腔，检查有无出血，有无内脏损伤，停止充入二氧化碳气体、取出腹腔镜以及几个穿刺点的穿刺套管并排除腹腔内二氧化碳，缝合穿刺口。