正常情况下，宫颈纳氏囊肿恶变的概率极低，但是建议患者定期到医院妇产科复查，出现异常后，可以及时治疗。
宫颈纳囊与宫颈糜烂不同，宫颈糜烂表示宫颈上皮表面有缺损，上皮下组织显露出来，宫颈表现由光滑红润变为粗糙颗粒的糜烂样。这种宫颈糜烂常常会招致HPV感染，或者导致HPV感染不易清除，是宫颈癌变的高危因素。一般宫颈纳囊表面光滑，很少引起癌变，但是对于宫颈纳囊和宫颈糜烂，都要定期检查宫颈TCT和HPV。如果有明显异常，要行阴道镜下多点活检，明确诊断，以除外宫颈癌前病变，甚至宫颈癌。
如果宫颈纳氏囊肿患者出现宫颈局部分泌物增多且颜色发黄，并且伴有腰骶部疼痛的情况下，可以做激光治疗，也可以通过冷冻来进行治疗。术后2个月再做相应的检查，了解局部是否已经痊愈。