诊断感染性心内膜炎的最重要的方法是血培养，血培养阳性是感染性心内膜炎重要的诊断依据。如果患者有发热，伴有心脏的杂音，特别是主动脉瓣关闭不全的杂音，而且有贫血、血尿、脾大、白细胞增高，有的患者还伴有栓塞，如果这时做血培养的阳性可以明确诊断。另外，有一些亚急性的感染性心内膜炎，这样的患者如果身上出现有瘀点、线状的出血，还有杵状指等等。也考虑是感染性的心内膜炎，这时可以通过超声心动图检查出赘生物也可以明确诊断。但是感染性心内膜炎的表现很多，没有什么特异性，诊断的同时需要与其它的疾病鉴别。