桥本甲状腺炎没有特殊的禁忌，饮食方面一般是普通饮食，但是明显会感到缺碘，而加碘以后，慢性桥本氏自身免性的甲状腺炎会增多。
有报道认为高碘饮食容易激发自身免疫性的甲状腺炎进展，所以一般都主张患者忌高碘饮食。所谓忌高碘饮食即不要吃太多的海产品，因为海产品的碘含量比较高。
同时要少吃含碘药物，因为有的患者营养均衡剂里有碘元素，而加碘食盐是为了预防碘缺乏病的国家策略，桥本氏甲状腺炎的患者可以买到加碘盐以后在干锅里面炒，加热以后碘就会挥发，可以采取这种方式均衡。
临床有一个药叫乙胺碘呋酮，心内科的患者常使用，吃乙胺碘呋酮的患者，如果是桥本氏甲状腺炎，要注意随访甲状腺功能。