治扁桃体肥大最好、最有效的办法是手术切除，通过全麻手术切除双侧肥大的扁桃体，使咽部宽敞，术后患者一般不会再出现打呼、憋气等情况。
如果扁桃体只是轻度或者是中度肥大，患者症状不是很明显，可以观察或者是用药物治疗，可以选择抗组胺的药物以及抗白三烯的药物，也可以采取侧卧睡眠以及减肥等一般治疗，一部分患者可以避免手术。