乳糖不耐受的检测方法包括以下几种：
一、氢呼气试验，如果乳糖不能够被消化，肠道里面的细菌会分解乳糖，从而产生一定量的氢气，通过测呼出氢气的水平可以间接的反映乳糖消化吸收的状况，做这个试验前一晚上应该避免摄入奶制品、豆类、面食及粗纤维的食物，检查当天需要空腹。
二、粪便的酸性测试，需要留取新鲜的大便送去化验，这个检查比较适合于婴儿。
三、乳糖的耐量试验，可以口服乳糖以后在多个时间点进行采血，化验血里面的乳糖含量。
四、小肠的活检，对于乳糖酶的缺乏是一个金标准，但是属于一种有创的检查，小婴儿可能比较难以接受。
五、如果没有条件进行实验室检查的患儿，可以尝试不含乳糖的食物，通常两周以内临床症状会消失，而再次食入这种含乳糖的食物以后，症状可以再次复发，这样是有助于诊断的。