异位妊娠最常见的部位是输卵管，在输卵管上面最常见的部位是输卵管的峡部。输卵管分为四个部位，输卵管的间质部最靠近子宫，从内到外就是输卵管的间质部、输卵管的峡部、输卵管的壶腹部、输卵管的伞端。
发生在输卵管的最多，输卵管上面输卵管峡部的发生率是最高的。除了输卵管之外还可以发生异位在卵巢上面、异位在子宫颈上面、异位在腹腔内。
还有异位在肝脏上面、肠管上面，这样的发生率比较低，但也是异位妊娠的一种。