输卵管堵塞的原因很多，最主要的原因是由于输卵管的炎症造成了输卵管的阻塞，输卵管的炎症又可以分为输卵管的黏膜炎和输卵管周围炎。输卵管的黏膜炎常由于生殖道的炎症，继发性的向上逆行感染，引起输卵管的黏膜发生炎症，黏膜功能受到了影响，使得输卵管的内膜的纤毛蠕动发生了改变，功能异常，甚至输卵管发生逆蠕动，这种情况容易导致输卵管的阻塞，管腔不通。
输卵管周围炎常由于输卵管周围炎症使得输卵管牵拉、扭曲变形、管腔不通，从而造成输卵管的阻塞。输卵管堵塞常导致不孕症，如果输卵管堵塞通而不畅，则容易引起宫外孕。