因为滴虫性阴道炎可以同时有尿道、尿道旁腺、前庭大腺滴虫的感染，因此要想治愈此病，需要进行全身用药。主要的治疗药物是硝基咪唑类的药物，全身用药初次治疗可以选择甲硝唑2g，单次顿服，或者用替硝唑2g，单次口服，也可以用甲硝唑，400mg,每日2次，连用7天，口服药物的治愈率能够达到95%，服用甲硝唑者，服药以后12-24小时之内，是要避免哺乳，服用替硝唑者服药后3天之内不要哺乳。滴虫性阴道炎因为属于性接触传播，因此性伴侣需同时治疗，并且告知患者性伴侣治愈前一定避免无保护性交。滴虫性阴道炎还需要做局部治疗，先用肥皂棉球擦洗阴道壁，并且用0.02%高锰酸钾溶液或者温开水冲洗阴道，再用酸性的洗剂，比如说1%的乳酸或者0.5%的醋酸来擦拭。阴道可以放置甲硝唑或者奥硝唑类内的栓剂。