尿路感染患者腰痛的厉害考虑是由于放射性疼痛，或者是由于输尿管炎症引起疼痛出现，腰疼的厉害是因为炎症可以使肾包膜扩张，或者是集尿系统扩张，是由于肾和输尿管疼痛引起。
疼痛可以是钝痛，可以呈持续性疼痛或者是阵发性疼痛。疼痛的区域主要在腰部或者是肋脊角区，即身体的骶棘肌两侧的十二肋下面，也可以出现锐痛，通常在胁腹部，有时疼痛也可以向腹股沟或者是同侧睾丸、同侧的阴囊部放散，也可以出现恶心、呕吐等全身不适症状。