系统性红斑狼疮脑病临床症状主要包括神经症状和精神症状，在神经系统损害中以癫痫最为常见，其次是脑血管病、颅神经麻痹、颅内高压、无菌性脑膜炎等。
在精神方面主要表现为精神病样反应，如视听幻觉、妄想、恐惧、被控制感以及器质性脑综合征表现，包括意识障碍、定向力减退、注意力涣散、记忆力差、行为异常等。
还可能会出现情感障碍及神经质反应，如狂燥、抑郁、焦虑、癔症、疑病等。在临床中，目前认为对本病诊断最有价值的表现为癫痫、精神症状、脑卒中、短暂性脑缺血以及无菌性脑膜炎。