房颤控制心室率的药物，可以选择β受体阻滞剂、钙通道阻滞剂或地高辛。因为永久性的房颤，治疗的目的应该是控制房颤较快的心室率为主。
β受体阻滞剂，例如美托洛尔、比索洛尔、阿替洛尔等等药物，这类药物的禁忌症包括急性心衰发作的时候，还有支气管哮喘以及外周血管病、糖尿病低血糖的时候、心率过慢的情况，包括二度或三度房室传导阻滞、停搏的患者。
房颤控制心室率，应用药物时要考虑到是否合并以上的因素。钙通道阻滞剂，例如地尔硫卓、维拉帕米，例如有严重心衰、二到三度房室传导阻滞、低血压的情况等等，都尽量不要应用钙通道阻滞剂。
地高辛比较适合快速房颤伴有心衰的病人，应用的期间应当避免中毒反应，要监测地高辛的浓度等等。