由于儿童脑肿瘤是涉及到上百种不同的疾病，分类也非常的复杂，有多种的分类方法，一种可以简单的分为良性和恶性，一种可以根据不同的部位分为鞍上肿瘤、松果体区肿瘤、后颅窝肿瘤、大脑半球肿瘤、小脑肿瘤等等。还有更详细的是根据不同的病理性质来进行分类，比如星形细胞瘤，比如髓母细胞瘤，比如颅咽管瘤、生殖细胞肿瘤、胚胎发育不良神经上皮肿瘤等，这些都是儿童脑肿瘤不同的分类。根据年龄段进行分类，比如新生儿的肿瘤、先天性的肿瘤等等。