扁桃体切除术用于慢性病扁桃体炎反复的感染，以及扁桃体表面的良性肿瘤，进行扁桃体及其肿瘤的切除。切除之后，扁桃体是淋巴组织在扁桃体的下级，或者扁桃体的上级，再生的淋巴组织如果不引起咽喉部的感觉，或者不引起炎症的发生，一般不需要进行特殊处理。如果继续引起反复的炎症发生，可以进行局部的再切除。扁桃体手术过后可能遗留有残体，现在手术已经是很少见了，因为现在主要是采取等离子的手术，或完整的剥离术，这种情况已经很少见到，但是也会有发生。