扁桃体肿了的药物治疗，分为两个方面：一个方面是急慢性扁桃体引起的扁桃体肥大，如果是急性扁桃体引起的扁桃体发炎，因为主要是感染因素所引起的，主要进行抗感染治疗，局部使用清热含片，可以吃头孢类的抗生素和清热解毒的中成药。严重可以输液，主要是头孢抗生素和糖皮质激素药物。如果慢性的扁桃体炎、扁桃体肥大反复发作，可以进行手术治疗。这是急慢性扁桃体炎。还有一种是儿童的扁桃体的生殖性肥大，对于这种情况一般不需要进行特殊的治疗，只需要观察就可以。对于生理性肥大，需要说明的是如果生殖性肥大引起睡觉、打鼾、呼吸，可能需要同时做检查，比如腺样体肥大，如果同时肥大，可能需要进行手术治疗。