肠炎发热主要是由于炎症所导致的，因此首先应当针对炎症给予正规积极地治疗，由于肠炎多是由于革兰氏阴性杆菌所造成的，如大肠杆菌，选择服喹诺酮类的药物口服效果比较好，常用的有诺氟沙星或者左氧氟沙星等。如果口服药物的效果欠佳，还应当给予静脉滴注治疗，可以选择第三代头孢菌素或者氨基糖苷类以及喹诺酮类药物进行治疗，常用的药物有头孢曲松，盐酸左氧氟注射液以及丁胺卡那霉素等，对于抗菌药物应用以后，如果出现体温仍然较高，超过38.5℃，可以考虑应用退烧的药物，如口服的布洛芬混悬液以及经肛门应用的吲哚美辛栓等，如果持续高温还可以应用糖皮质激素，如地塞米松，局部还可以运用温毛巾擦拭颈部、腋窝、腹股沟等，大血管较为密集的区域，必要时还可以用酒精进行物理降温，同时对腹泻明显地患者还可以应用止泻的药物，常用的有蒙托石散。