贲门炎与贲门癌的区别主要是贲门炎属于胃炎，是良性病变，而贲门癌属于恶性肿瘤，两者的预后完全不同。贲门炎经过抗炎治疗，大多能够痊愈，复发几率很低，而贲门癌属于胃食管交界处的恶性肿瘤，有其自身的病理学特点。
由于癌组织生长方式的不同，在大体形态上也有所不同。以外向性生长为主时则向腔内隆起，以内向型生长时则扁平或者凹陷。依照此原则，贲门癌早期的分型大概分为三种类型：一、是隆起型。二、是凹陷型。三、是平坦型。
在组织学上的表现，早期贲门癌的病理诊断标准，系癌组织为累及基层也无淋巴结转移，包括黏膜内癌和黏膜腺癌。在肉眼的区别上，贲门炎和贲门癌不容易区别。但是对于中晚期的贲门癌，不管是在大体类型上还是组织学表上，是与贲门炎有明显区别的，很容易鉴别。