子宫内膜异位症的最佳治疗方法，有药物治疗，还有手术治疗。如果在临床检查过程中发现卵巢上发生了巧克力囊肿，并且体积比较大，需要做手术治疗。如果是单纯的痛经，没有发现包块与结节，可以利用药物治疗，比如丹那唑，是一种雄性激素的药物，效果比较好，需要1个月皮下注射1次，非常方便。这种药物可以造成女性内膜的萎缩现象，也就是假绝经疗法。另外子宫内膜异位症，还可以上曼月乐环，造成内膜变薄，不来月经，这也是一种治疗的方法。