在得甲亢的同时，TPO抗体和TG抗体异常升高，如果能够诊断桥本甲亢，抗体升高的幅度一般需要在正常值上限的50-100倍，说明抗体很高。甲亢的治疗和普通甲亢没有区别，也是三种方式，吃抗甲状腺的药物、用碘-131的办法，或者用手术方法。
因为这两个抗体的异常升高，桥本甲亢在治疗期间的变数，比普通Graves病的甲亢要多一些。有的桥本甲亢患者口服药治疗久治不愈，什么叫久治不愈，就是会反复的复发。有一些桥本甲亢的患者因为桥本病，本来甲功就可以在正常甲亢、甲减之间自由转化，所以有的时候有一些患者，可能不需要治疗那么长的时间，就自动转化成正常，甚至转化成甲减，所以桥本甲亢在临床还比普通的甲亢要稍微疑难一些。