胆管癌晚期的患者都是由于肝、肾等多器官功能衰竭而造成死亡的。晚期胆管癌的患者多会有不同程度的黄疸，合并胆管炎时还会出现右上腹剧烈的疼痛、寒颤高热、黄疸，甚至出现休克。门静脉高压可以导致上消道出血，晚期病人还多出现肝肾综合征，出现少尿和无尿。
对于黄疸的患者，可以选用经皮肝穿刺、胆道置管引流或者放置内支架，经内镜鼻导管引流或者放置内支架，同时给予保肝、护肝，应用血浆、浓缩红细胞、人血白蛋白等对症处理。如果出现胆管炎，还应当选用敏感的抗菌药物，进行抗感染治疗。此外，对于疼痛明显的患者，还可以应用吗啡或者哌替啶来进行止痛。