肝内胆管结石是否会引起严重的临床症状，还需要根据胆管结石所处在的位置，结石的大小以及结石附近胆管和肝脏是否存在了病理生理改变而决定。如果结石较小，处于终末支没有明显的临床症状，这种情况下也可以给予定期彩超随访观察。如果结石位于较大的分支，且反复诱发胆管炎，出现了胆管的狭窄或者肝脏的萎缩。这种情况下临床上都会出现有上腹的疼痛、发热、黄疸、寒战等。严重的患者还可以造成所属病变肝脏的化脓性的改变，如出现肝脓肿引起比较明显的菌血症状，这种情况下还应当给予积极的处理。部分肝内胆管结石反复诱发胆管炎，还会造成肝脏的纤维化以及肝癌的形成。这种情况下会严重影响患者的生存期，需要及时给予手术处理。