根据医院的级别，以及相关设备的先进程度不同，导致经颅磁治疗费用也会不同，经颅磁治疗费用约为100元左右，经颅磁治疗的产生是因为在医院的神经科康复科、儿科等，各个方面都要采用此种方式，治疗患者的相关疾病。
此种治疗是一种无痛、无创的绿色治疗方法，通过透过锣鼓刺激大脑的神经，不会局限于头脑的刺激，可以刺激外周神经肌肉，达到治疗抑郁症、精分症、脑瘫、抽动症、自闭症等疾病。
经颅磁治疗可以有效的改善大脑内部血液的循环，以及脑氧环境，促进细胞的生长发育，加快大脑的功能转换，调节自身的神经递质释放，加快自身的神经网络功能重建，提高自身的智力。