艾灸起水泡的原因主要是以下两个：
第一、绝大多数的艾灸以后起水泡都是因为艾灸的温度过高或者时间过长引起的，艾灸是用中药艾叶经过鞣制以后做成艾绒，点燃以后以艾绒的热量来熏灸人体的穴位，达到治疗作用的一种方法。因为在这个过程中会产生热量，所以患者往往会感觉皮肤灼烧的感觉。但是如果控制好这个量和时间的话一般是不会起泡的，但如果操作不慎，艾灸的器具，也就是点燃的艾绒距离皮肤过近的话，那么就会使皮肤烫伤形成起泡，对于糖尿病的患者尤其是这样。
第二、是比较少见的一个方面就是患者对艾灸、艾条当中的某些化学物质，如焦油等过敏，接触了艾灸以后也会起水泡，但这种情况临床是比较少见的，通常艾灸起水泡都是因为烫伤引起的。