麻黄止嗽胶囊的副作用，在说明书上写的是尚不明确，但是在临床实际应用中，麻黄止嗽胶囊的成分中含有麻黄、川贝、五味子等，特别是麻黄，它的副作用非常明显。该药中含有麻黄素，对于心脏、中枢神经副作用较多，有高血压、冠心病、甲状腺功能亢进、青光眼、前列腺肥大的患者，都应该谨慎应用。
该药对于心脏的兴奋作用会产生影响，影响心率，所以心律失常的患者应该谨慎应用麻黄止嗽胶囊。该药在应用过程中出现一系列的异常情况，如心慌、胸闷，甚至慢性病加重，要及时到医院就诊。麻黄止嗽胶囊在临床应用中主要是解表散寒、宣肺化痰、止咳平喘，针对于肺部疾病进行治疗，如感冒、鼻塞，还有气管炎导致的咳嗽、咳痰，都有一定的效果，需要在医生的指导下应用。