新生儿眼睛里面有睫毛的处理方法要根据情况来定，如偶然的睫毛、倒睫等，具体如下：
1、偶然的睫毛：如果是偶然掉进去的睫毛，外面可以看到眼睫毛，可以把手洗干净，然后用干净的棉签把它粘到眼睫毛上面，随着宝宝眨眼，会慢慢被结膜和角膜的摩擦推到眼睑，粘在眼睫毛上，顺着眼睫毛慢慢拉到眼角的地方就可以把它去掉，有时候流眼泪也会把它冲掉。
2、倒睫：如果眼睛里面经常有睫毛，可能是有倒睫，如果有倒睫，需要到医院请眼科医生来进行处理。