针灸治疗偏头痛的穴位有很多，最常用的，比如用丝竹空、瞳子髎、太阳、率谷、角孙以及风池、腕骨、百会、四神聪，这样的局部头部的取穴经常用。
另外，也经常采用四肢的穴位，比如外关、足临泣、八脉、交会穴的使用，以及合谷、太冲，它可以疏肝解郁，可以止痛。另外，可以沿着手三阳去寻找，经常取俞穴的几率很高，比如用中渚，也有用三阳络、四渎，另外如果是病人的气虚比较重的，也可以采用一些补益的方法，用气海、关元这样的俞穴。